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├── bottomly
│ ├── calls
│ ├── countReads.R
│ ├── diffExpr.R
│ ├── getPheno.R
│ ├── random_calls.txt
│ ├── random_subsets.txt
│ └── README
├── pickrell
│ ├── calls
│ ├── countReads.R
│ ├── diffExpr.R
│ ├── getPheno.R
│ ├── good_set.txt
│ ├── random_calls.txt
│ ├── random_subsets.txt
│ ├── readlength.txt
│ └── README
├── makeSim.R
├── runScripts.R
├── simulateCluster.R
├── simulateDE.R
├── simulateLFCAccuracy.R
└── simulateOutliers.R
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